水生生物多樣性與資源保護研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 曹宏
• 曹文宣
• 陳毅峰
• 何德奎
• 何舜平
• 劉煥章
• 王丁
• 王劍偉
• 王克雄
• 謝志才
• 張鶚

淡水生態學研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 蔡慶華
• 曹特
• 陳宇順
• 陳雋
• 段明
• 龔迎春
• 郭傳波
• 韓冬
• 解綬啟
• 金俊琰
• 劉家壽
• 唐濤
• 王洪鑄
• 謝平
• 徐軍
• 張堂林
• 朱曉鳴

魚類生物學及漁業生物技術研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 昌鳴先
• 桂建芳
• 胡煒
• 李愛華
• 李文祥
• 羅大極
• 聶品
• 孫永華
• 童金茍
• 汪亞平
• 汪洋
• 王桂堂
• 王忠衛
• 吳山功
• 夏曉勤
• 謝海俠
• 徐鎮
• 張義兵
• 周莉
• 朱作言

水環境工程研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 曹秀云
• 陳聯國
• 方濤
• 李敦海
• 李根保
• 李清曼
• 劉碧云
• 劉劍彤
• 邱東茹
• 宋康
• 吳辰熙
• 吳振斌
• 肖邦定
• 周炳升
• 周巧紅

水生生物分子與細胞生物學研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 葛峰
• 韓丹翔
• 侯宏偉
• 李濤
• 孫玉華
• 肖武漢
• 熊杰
• 殷戰
• 趙進東
• 繆煒

藻類生物學及應用研究中心 (按姓氏首字母排序)

• 畢永紅
• 甘南琴
• 胡春香
• 胡晗華
• 黃開耀
• 劉國祥
• 寧德剛
• 宋立榮
• 王高鴻
• 徐旭東
• 張承才
• 張學治

淮安研究中心 (按姓氏首字母排序)

水生生物數據分析平臺 (按姓氏首字母排序)

• 甘小妮

科研業務處 (按姓氏首字母排序)

• 賀鋒